时间统筹之载体构建篇
作者:明日百傲 日期:2008-3-14 17:35:00

早就想写些实验操作方面的东西,可每次提笔又有些犹豫,想想大家多为业内人士,这次写出来算是交流吧。有什么意见、建议,大家可以尽情发言讨论,原则只有一点,尽快把自己的实验做好!

分步进行,引物设计及测序与测序结果分析请细心进行,不要贪快,只求精准,当然有时候引物是需要尝试才能确定的。

1. PCR扩增。一般引物会在上午送到,赶在午饭之前做上,可以省出午饭及午休时间,如果能更早一些做上当然更好。PCR反应一般1~3h不等,做的时候需要算好时间,提前把回收胶倒好,以便PCR结束即可使用。

2. 回收。上样加电泳一般30min即可,记住电泳前把金属浴或水浴锅打开,一般达到55~65度约需10min,未免遗忘早做准备。胶回收建议还是用试剂盒吧,至于如何挑选盒子我就不多说了,经济实惠的国产货绝对可以。回收一般25~30min。

3a. 可选操作。PCR产物有时可直接用来酶切,酶切一般0.5~2h即可,当然要考虑片段大小及酶切难易程度。本人曾切过最小70bp,连接效果OK。为测序方便及保险起见,连T几成常规。

3b. 连接,室温连30min~2h通常可满足要求。需根据片段大小比例考虑。现行的topo连接载体可缩短时间至几min,但事先一定要确定内切酶的问题。

4. 转化。常规操作,总体下来到涂板1.5h可以搞定。

5.划线及PCR鉴定、摇菌。根据菌株差异,7~12h可进行划线、菌P。菌株选择可根据时间选定。A)如果上午能做上转化,可选用克隆菌株JM109,Top10,Mach1 T1等,晚上8点~10点左右可划线、菌P,之后电泳检测,可选阳性摇菌。B)如果下午早些时候转化可用BL21,基本上也能赶上摇菌。C)再晚的话,建议转化Mach1 T1,XL1 Blue, 涂板后可等到次晨进行划线鉴定,鉴定后上午摇菌。此处各菌株属性及使用利弊请自行查阅。

6.提质粒,酶切鉴定。建议用试剂盒提吧。国产的花不了几个钱还能节省时间。如果不是做转染的话没必要花银子买更高级的。如果第5步采用A)或B)的话,次日上午提质粒,酶切鉴定(酶切用微波炉中火2min可行,常规酶切10~30min可行,一般常用内切酶各公司的使用效果无太大差异。切忌不要抱有越贵越好用的心理,我们是做科学的,当以科学的眼光评定)。如果第5步采用C)的话就等着晚上再提吧,当然这天上午你也不能闲着,下午到可以该干嘛干嘛^_^

7.送测序。这工作留给公司去做吧,自己做虽然能学点东西,但送公司的话可能更便宜,省出的时间可以干点别的。第5步采用A)或B)的可以赶在下午2点左右送样,这样的话或许能赶上当天那批安排测序,否则的话只好多等一天。采用C)的话就只好等到第三天叫测序了,相应的会再推迟一天。

时间总体统计我就不一一算了,课题说是老板的,但是实验是自己的,如何安排应该多思量。操作看上去简单,原理的把握一定要花些心思的,要不然我们干吗算是脑力劳动者呢?

以上是自己做载体方面的一些体会,个人看法,欢迎不同意见加入讨论。还有一句话要说的就是,老板们切忌以此例“过分严格的要求”学生,而应想办法让学生学会主动积极的去做;师者,传到授业解惑,倘一味苛求,何以称其为师?学生切忌以此例“寻规照搬”,其间有些细节此处未能尽讲,当熟谙原理及各时段安排,方可妥善应对。

一句话,不做则已,做就要有结果。套用BIOFUTURE用在《遗传》广告栏上的一句话“Do It Yourself, Your Future Is In Your Hand”

 

辛宇心愿:愿大家有所获,所谓交流即有收获;愿大家有所得,所得大于所见,所谓 意----犹未尽

  • 标签:载体构建 
  • Re:时间统筹之载体构建篇
    作者:访客vb6DUh(游客) 日期:2008-4-15 23:58:00
    访客vb6DUh(游客)呵呵
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    Re:时间统筹之载体构建篇
    作者:访客HLCo26(游客) 日期:2008-3-26 12:48:00
    访客HLCo26(游客)支持一下!
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